《名侦探柯南》里有几个人知道案子是柯南代替小五郎破的

阿笠博士这时肯定的，装备都是阿笠博士给的，也是新一变小后找的第一
服部平次，新一的好朋友，但是两人也是对手，和新一一样也是一名高中生名侦探，大家常常说的“关东的工藤，关西的服部”，其中的服部就是指的平次。
是在破一起案件的时候发现柯南的真实身份。
灰原哀，都是因为服用药物变成小孩子模样的，寄宿在阿笠博士家里，当然也知道柯南。
波本，表面是私家侦探、餐厅服务生，在毛利侦探事务所楼下的咖啡厅打工，并拜毛利小五郎为师，有极强的观察力与推理能力。
为了调查毛利小五郎与雪莉是不是存在某种关系。
慢慢的也发现了柯南的身份。
苦艾酒，也是黑衣组织的成员，知道柯南以及灰原哀的真实身份，不过对柯南并没有敌意，是柯南认为可以摧毁黑衣组织的重要人物。
还有柯南的爸妈啦，工藤优作以及工藤有希子，赤井秀一估计也知道。

参考：
按《名侦探柯南》的剧情顺序，有这么几
在部分案件中，阿笠博士也充当柯南的推理身份，并且制作了一系列道具方便柯南使用。
2、工藤夫妇工藤优作和工藤有希子回国后也是听阿笠博士说明过柯南的的情况，并且还与柯南开了个玩笑，而以工藤优作的头脑，自然会明白柯南是协助毛利小五郎一起破案的。
3、服部平次服部平次会知道完全是个意外，服部平次刚登场的时候就带着疑问，其实是怀疑毛利小五郎一下子推理那么厉害是不是有人帮忙，在外交官杀人事件中，柯南本来是想借用麻醉服部让他做案件推理的角色，但偏偏麻醉效果不好，推理到一半的时候服部平次就醒了，然后继续装睡配合柯南把推理说完，在结束后服部平次就质问柯南，柯南无奈把真相告诉了服部平次。
4、灰原哀作为APTX4869药品开发人员，首先是非常清楚柯南的真实身份的，而在其后不少案件中也接触到柯南的各种推理秀，自然是知道毛利小五郎的推理都是来自柯南。
5、安室透来自黑衣组织的一员，真实身份是日本公安，同时也是毛利小五郎的弟子，具有非常敏锐的洞察力和高超的推理能力，毛利小五郎的推理水平他很清楚，只是没有说破而已。
还有几个角色像贝尔摩德、赤井秀一、世良真纯等并没有明确提到过柯南与毛利小五郎的推理有关，最多只能说可能知道。

参考：
阿笠博士、灰原哀、工藤优作、工藤有希子、服部平次、贝尔摩德、赤井秀一、领妹、世良真纯、怪盗基德（黑羽快斗）、安室透、灰原哀的姐姐、鲁邦三世、宏树（诺亚方舟）其他的我就不知道了
参考：
阿笠博士??工藤新一的父母??灰原哀??黑羽快斗也就是怪盗基德??服部平次??